Míg korábbi rejtélyek megválaszolódnak, újabbak kerülnek előtérbe. 

Nem sokkal később Michael elindul és megkeresi a fiát, de egyedül akarja ezt csinálni, így Shephardöt és Locke-ot bezárja a bunker fegyverraktárába. 

Miután sikerül kiszabadulniuk, Jack, Locke és Sawyer utána megy, hogy segítsenek, ám az egyik éjjel a többiek területére tévednek. 
---
Itt találkoznak Tommal, az álszakállas úriemberrel, aki a többiek vezetőjét képviseli. 

Hosszas beszélgetésükben rátérnek arra, hogy mit nem szabad csinálniuk a túlélőknek a szigeten, hiszen ez a hely nem az övék. 

Megpróbálja rábírni Locke-ékat, hogy tegyék le a fegyvert és távozzanak, ám Jack nem hisz a fenyegetéseknek és nemet mond. 

Ekkor egy ismerős nevet szólítanak: „Alex, hozd ide őt”.
Egy nőt hoznak ki zsákkal a fején, akiről kiderül, hogy Kate az. 
Utánuk ment, hogy segítsen, ám terve balul sült el. 

Ezzel meggyőzték őket, hogy távozzanak, ám még itt nincs vége a harcnak. 
---
Miután visszatértek, elkezdték kidolgozni a tervet,hogy hogy is lehetne legyőzni a többieket. 

Váratlanul Russeau,a francia hölgy bukkan fel, hogy talált valakit az erdőben, és meg van győződve róla, hogy a többiek közé tartozik. 

Az úriembert, álnevén Henry Gale-t a bunkerbe viszik és elkezdik kérdezgetni. 
Elmondja, hogy egy hőlégballon-szerencsétlenség áldozata lett, és feleségével lezuhantak, ám a nő nem élt sokáig. 

Sayid azonban nem hitt neki, és megkínozta,
​de nem jutott előrébb. 
Rajzoltattak vele egy térképet, hogy megkeressék a hőlégballont. 

​Míg Sayidék távol voltak, Locke és Henry magukra maradtak, és egy szokatlan dolog történik: a bunker ajtajai lezáródnak, a gombot pedig meg kell nyomni. 

Az ajtók zárásakor Locke-nak megsebesül a lába, az egyik ajtó rácsukódik. 
Ekkor megkéri Gale-t, hogy nyomja meg a gombot, ám a férfi később azt hazudta neki, hogy nem csinált semmit, a veszély mégis elmúlt. 

Míg feküdt, Locke látott egy hologramtérképet, amely egy ötszöget ábrázolt, közepén egy hatodik ponttal, mindegyik pont egy kérdőjel volt. 

Miután lerajzolta a térképet, Mr. Eko a segítségére ered,
mivel Locke már nem hisz többé a "gombnyomogatásban". 
---
Útjuk során Eko rájön, hogy a rajz egy térkép,
amely a DHARMA kezdeményezés hat fő állomását jelzi. 

Ekot álmok vezetik, álmaiban az öccse, Yemi jelenik meg,
és ő irányítja. 
Végül megtalálják a bunkert a régi sárga gép roncsai alatt,
ami kiderült, hogy Eko gépe volt, az ő drogokat tartalmazó
Mária-szobrai voltak benne az öccsével együtt.

A gép pont a bunker tetejére zuhant, amit kinyitottak. 
---
Mikor leérkeztek és felkapcsolták a villanyt, egy hatalmas szekrény tele televíziókkal jelent meg, amelyeken a többi állomást figyelték meg. 

Itt Locke teljesen elvesztette a hitét, és eldöntötte, hogy nem fogja többet megnyomni a gombot, ebbe a tervébe Desmondot is belevette. 

Eko azonban egy különös dologra lesz figyelmes: a kulcs a nyakában elkezd magától felemelkedni, mikor elhalad egy vasszerkezet mellett a bunkerben.
​Ekkor ő már tudja, hogy ez nem lehet hazugság. 

Harmadik évad

A lezuhanás utáni 67. naptól kezdődően folytatódik a történet. 

A bunker felrobbanása után a dolgok egyre rosszabbra fordulnak. Több haláleset is történik, ráadásul megdöbbentő információkat kapunk a szigetről. 

Egyre több mindent tudunk meg a „Többiek”-ről,
és arról, hogy ki milyen ember is valójában. 

Miközben felcsillan a megmenekülés reménye,
​végzetes összecsapás készülődik a túlélők és az őslakosok között. 

Ahogy a túlélők egyre inkább részesei lesznek a Többiek életének, úgy mosódik el a határ jó és rossz között.

Első évad

Az Oceanic Airlines 815-ös, Sydney – Los Angeles repülőjáratán valahol félúton a Csendes-óceán felett meghibásodik a fedélzeti rádió, így a pilóták a közelebbi Fidzsi-szigetek felé veszik az irányt,
hogy a hibát ott kijavíttathassák. 

Egy lakatlannak tűnő, trópusi sziget felett azonban – a tervezett útvonaltól mintegy 1000 mérföldre – a gép erős turbulenciába kerül és három nagyobb részre szakadva lezuhan. 
---
Az első évad a tengerpartra zuhant törzsrész túlélői szemszögéből ábrázolja a történteket. 

Az első sokkból felocsúdva néhányan – nem tudván, hogy a berendezések meghibásodtak – elindulnak a sziget belsejében lezuhant orr-részt megkeresni, hogy annak rádióján keresztül hívhassanak segítséget. 

Az ott még élve talált másodpilótától kapott kézirádióval egy másik csoport indul el a sziget magasabb tisztásai felé, a jobb vételben reménykedve.
---
Kapcsolatba lépniük ugyan nem sikerül senkivel, ám befognak
egy 16 éve sugárzott, francia nyelvű segélykérő üzenetet. 

Mivel ebből következik, hogy a segítség immáron 16 éve nem érkezett meg, a csoport tagjai megállapodnak abban, hogy felfedezésüket – elkerülendő a hisztériát – titokban tartják. 

Szintén nem mindenki értesül arról, hogy mindkét csoportot támadás érte az erdőben; az elsőt – megölve a másodpilótát – egy füstgomolyag, a másodikat egy jegesmedve támadja meg. 

A túlélők 72 fős táborából így az alapján, hogy kinek mennyi információ áll rendelkezésére, elkezdenek kiemelkedni a vezető karakterek, 
a sérültek ápolása kapcsán is pedig különösen Jack Shephard,
egy Los Angeles-i sebészorvos. 

A nézeteltérések a repülőgép étel- és italkészleteinek fogyásával egyre inkább élesednek; 

a kényszer végül gyűjtögető utakra viszi az életben maradtakat, John Locke vezetésével pedig megindul a vadászat a szigeten élő vaddisznókra. 
---
Idővel Locke állandó vadászpartnerévé lesz Boone Carlyle, akivel egy útjuk alkalmával egy földbe ásott, lezárt betonbunkert fedeznek fel. 

Ugyan innentől kezdve minden idejüket ennek kinyitására szentelik (sikertelenül), azonban – bár jó néhányan érdeklődnek afelől, hogy miért térnek vissza minden vadászatukról üres kézzel – a csoportnak nem árulják el, hogy mivel foglalatoskodnak. 

A túlélők közül többeket különös álmok és víziók kezdenek gyötörni. 
Locke egy valószerű álmában egy lezuhanó kisgépet lát, amit később Boonenal együtt egy szikla tetején imbolyogva valóban meg is találnak. 
---
A gép bizonytalan egyensúlya azonban megbomlik Boone alatt, amikor az felmászik hozzá, s ő a zuhanás során halálos sérüléseket szenved. 

Boone végül Jack karjaiban hal meg, aki nem tudja jól ellátni, részben mivel Locke félretájékoztatta őt a baleset körülményeiről. 

A két vezető karakter ellentéte ezzel kiélesedik, s Locke végül kénytelen lesz felfedni a csoport előtt a kisgép és a bunker létezését is. 
---
A repülőgépet mindazonáltal drogcsempészek használták, s az tele van heroinnal – válaszút elé állítva ezzel Charlie Pace karakterét, 
aki csak a szigeten és Locke erőteljes ráhatására hagyott fel
a kábítószerrel. 

Jack fényes nappal többször is látni véli korábban meghalt apját,
​s ezen víziói végül egy barlangban felfakadó forráshoz vezetik.

A vízhiány miatt és nagyobb biztonságot keresve a túlélők szétválnak: egy részük a barlanghoz költözik, 
a többiek azonban – bízva abban, hogy egy arra haladó repülő vagy hajó ott könnyebben meglátja őket – a parton maradnak.