19
Egyre inkább bebizonyosodik az NTAC-ról, hogy a kísérleteik közben, melyeket a 4400-asokon végeznek, a tesztalanyok a kínok-kínját élik át. 

De vajon sikerül-e Tom-nak és Diana-nak lelepleznie a háttérben zajló szörnyűségeket, mielőtt még túl késő lenne?

13
Jordan Collier váratlan halála minden 4400-akkal kapcsolatos tényt megváltoztat. 

Tom életéből az összes nyom eltűnik, és szinte olyan, mintha a 4400-as ügy meg sem történt volna. 

Már-már mindenki őrültnek nézi, amikor felbukkan egy Alana nevű nő, aki szintén a visszatérők közül való. 
Közösen próbálják kideríteni a történteket, miközben eltelik nyolc év, és ők ketten egy párrá válnak.
----
14
Tom és Diana egy titokzatos vírus után nyomoznak, ami egy visszatérőtől származik. 

Jean, ha ideges, mindenkit megöl maga körül, így elég nagy veszélyt jelent az emberiségre. 

Shawn teljesen összeomlik Collier halála és a hatalmas felelősség miatt. 
Szerencsére akad egy új segítője Matthew Ross személyében, ám a férfi egészen más mentor, mint Collier volt. 

Kyle-nak eszébe jutnak az időkimaradások és rájön, hogy ő gyilkolta meg Collier-t. 

Eközben a hivatalban is előrelépés történik az ügyben, mivel már van fantomkép.

15
Kiderül, hogy az egyik visszatérő, Edwin Mayuya hasonló képességekkel rendelkezik, mint Shawn, de a múltja sötét titkokat rejt. 

A férfinak ugyanis köze van a luandai tömeggyilkosságokhoz, így elég nagy fejtörést okoz a hivatalnak. 

Matthew azonban a háttérből manipulálja a dolgokat és végül megszerzi a központnak Edwin-t. 

Shawn kibékül a családjával, de Kyle-nak nem tud segíteni. A fiú ugyanis elmenekül a történtek miatt. 

April is elhagyja a várost, de még időben sikerül kibékülnie Diana-val. Richard eközben találkozik a régi bajtársaival.
----
16
 Az NTAC előrébb jut a Collier ügyben, de erről Tom mit sem sejt, mivel eközben Kyle-t keresi. 

A keresés alatt azonban rádöbben, hogy a fia nem más, mint Collier gyilkosa, így még az ügynökség előtt elkezdi eltűntetni a nyomokat. 

Ez látszólag sikerül is, de Maia jóslata könnyedén felboríthat mindent. 

Shawn egyre elfoglaltabb, így nem nézi jó szemmel öccse, Danny és Liv kapcsolatát, ami aztán persze nem a vártnak megfelelően alakul.

17
Amikor Maia megbetegszik, Diana azonnal beviszi őt az NTAC-hoz, 
ahol azonban egy 4400-as éppen merényletet készül elkövetni Jordan Collier születésnapjának évfordulóján. 

Eközben Kyle élete lassan visszarázódik a normál kerékvágásba, ugyanis újra járni kezd az egyetemre, 
ahol ráadásul még egy kedves lány is felkelti az érdeklődését. 

Shawn egy interjú hatására úgy dönt, hogy ideje lenne változtatásokat eszközölni a központban. 

Lily az idő múlásával pedig egyre inkább kétségbe vonja Isabelle szavahihetőségét.
----
18
A Földre visszatért 4400-ak mindegyikét különös és halálos kimenetelű betegség támadja meg egy időben, 
miközben Tom és Diana értetlenül állnak az eset előtt. 

Dennis Ryland visszatér az NTAC-hez és azonnal népszerűtlen intézkedéseket léptet életbe, melyek a központ működését is korlátozzák. 

Nem sokkal később pedig szörnyű és megdöbbentő titok jut Tom-ék tudomására, mely a kormánnyal kapcsolatos.

2x13     Mommy's Bosses     Mami főnökei     
Tom és Diana megtalálja a vírus forrását – ami megváltoztatja eddigi életüket.

2x10     Hidden     A rejtekhely     
Az NTAC és Tom az idővel versenyeznek, mivel mind a ketten közel kerülnek Jordan Collier gyilkosához.

2x11     Lockdown     Lezárás     
Az NTAC központját rendkívüli vesztegzár alá helyezik, mikor egy 4400-as terrorista támadást intéz ellene.

2x12     The Fifth Page     Az ötödik oldal     
Az egész világ 4400-asait megbetegítő vírus terjed, amint Tom és Diana elkezd nyomozni egy rémisztő összeesküvés közepébe találják magukat.

2x07     Life Interrupted     Félbeszakított élet     
Tom egy olyan világban találja magát, amiben nem történt meg 4400 ember eltűnése.

2x08     Carrier     A hordozó     
Egy visszatérőnek a képessége egy mozgó pestissé változtatta őt, ezáltal azt hiszi, hogy ő a következő Messiás.

2x09     Rebirth     Újjászületés     
Tom és Diana egy 4400-as után nyomoznak, aki képes a magzatok rossz génjeit "megjavítani".

2x04     Weight Of The World     A világ súlya     
Tom és Diana egy 4400-as után nyomoznak, aki eladja magát, mint egy tökéletes fogyókúrát, mivel a szervezetében egy különleges anyag termelődik.

2x05     Suffer The Children     Engedjétek a gyermekeket     
Tom és Diana egy 4400-as tanár után nyomoz, aki rosszul bánt a tanítványaival.

2x06     As Fate Would Have It     Akár a végzet     
Maia egy látomása szerint veszélybe kerül a 4400 Központ.

2x01 2x02     Wake Up Call     Ébresztő 1.-2.     
Tom és Diana egy pszichiátrián nyomoznak, mely kórházban egy skizofréniával küszködő 4400-as van, Tess Doerner. Richard-nak meg kell védenie a családját, amikor kiderül, hogy ő és Lily 4400-asok.

2x03     Voices Carry     A hangok ereje     
Egy visszatérő, telepatikus képességeit bevallva segítséget kér az NTAC-tól, de ahelyett, hogy segítséget kapna felhasználják Jordan Collier 4400 Központjában való nyomozáshoz.

Kyle megpróbál beiratkozni a főiskolára, de ott elutasítják,
mert az apja nem fizette be a tandíjat.
Lily pénzt lop egy motel pénztárából.

7
Egy év telt el a 4400-ak visszatérte óta, de még mindig nem rendeződött az ügyük. 

Jordan Collier, Shawn-nal karöltve elkezdi építgetni a birodalmát, ami persze nem nagyon tetszik a kormányszerveknek.

Tom-ot nagy nehezen visszaveszik a csapatba és Kyle-t is kiengedik. 

Közben Lily gyermeke is megszületett már, és folyamatosan védelmezi az édesanyját, mivel valami készülőben van, ám ezt Richard nem akarja elhinni. 

Tom és Diana egy új ügyet kapnak, ahol is egy furcsa jelenséget kell megfigyelniük. 

Tess az egyik visszatérő valahogyan irányítja egy elmegyógyintézet lakóit és arra kényszeríti őket, hogy egy adóvevőt készítsenek.
----
8
Tom a vezetőség döntése ellenére visszaviszi Tess-t a kórházba és folytatja a torony építését. 

Kyle és Shawn találkoznak, ami persze nagyon nem tetszik Collier-nek. 

Lily és Richard menekülni kényszerül néhány 4400 ellenes ember elől, de szerencsére a kicsi Isabelle megvédi őket. 

A torony működésbe lép, azonban egyelőre eredménytelenül. Ez viszont csak a látszat, mivel egy igen nagy jelentőségű tudósember éled fel a lökés erejétől. 

Eközben kiderül, hogy Maia látomásai mégse szűntek meg, csak titkolja őket.

9
Lily és Richard egyre nagyobb bajba keverednek, de szerencsére Isabelle mindig segít nekik. Ez viszont már kezd egyre rémisztőbbé válni Richard számára. 

Eközben úgy tűnik, hogy Kyle kezd visszazökkenni a régi életébe, de ugyanez azonban nem mondható el Shawn-ról, akinek egyre több a vitája Collier-rel. 

Tom és Diana, - hogy rájöjjenek Collier tervére - egy 4400-ast, Navarro-t küldik a központba, aki igen érdekes összeesküvés nyomaira bukkan.
----
10
Collier viselkedése egyre jobban kiábrándítja Shawn-t, de a fiú nem tehet semmit ellene, hiszen előbb-utóbb az övé lesz az egész intézet. 

Mivel Maia nem titkolja el a képességét, akár bajba is kerülhet. 

Lily és Richard között a viszony egyre feszültebbé válik a folyamatos menekülés miatt. 

Tom és Diana eközben egy 4400-as képességeire keresik az ellenszert. 
A férfi ugyanis bárkit le tud fogyasztani, ám ezzel együtt a halálukat is okozza. 

Kyle egyre jobb viszonyba kerül a tanárnőjével, de még sincs minden rendben vele, mert olyan mintha valaki más is lenne a testében.

11
Shawn összebarátkozik néhány hajléktalannal és segít rajtuk, de aztán a jóhiszeműsége csapdájába esik. 

Richard-ot letartóztatják, de Collier kihozza őt a börtönből és egy érdekes üzletet ajánl a férfinak. 

Tom és Diana egy tanárnő ügyében nyomoznak, aki képes kihozni egy gyerekből a szunnyadó képességet. 
Ez persze nem tetszik a szülőknek, ami hamar bajhoz vezet. 

Kyle-nak egyre gyakoribbak az idő kihagyásai, ami később komoly gondokat eredményezhet.
----
12
Maia-nak látomása lesz Collier haláláról, de a férfi nem akar tudomást venni róla, s a feltételezett veszély ellenére megtartja a közelgő ünnepséget. 

Tom és Diana persze végig mellette állnak, akárcsak Shawn. 

Collier vesztét végül aztán Isabelle víziói okozzák, miszerint túléli az ünnepséget, melyek azonban nem valósak. 

A halála bekövetkezik, a helyét pedig Shawn veszi át a központban. 
Ezzel azonban még nem zárul le az ügy, mivel Collier teste egyszerűen eltűnik.